III Школа молодых ученых «Применение синхротронного излучения для решения задач биологии»

Открыта регистрация на III Школу молодых учёных «Применение синхротронного излучения для решения задач биологии», которая пройдет с 18 по 20 сентября 2024 года в Новосибирском государственном университете (Новосибирск, Академгородок, ул. Пирогова 1 и Пирогова 2).

Цель школы - рассказать о возможностях синхротронного излучения для проведения исследований в области структурной биологии, познакомиться с основными этапами структурных исследований биополимеров методами рентгеноструктурного анализа и малоуглового рентгеновского рассения. 

К участию в школе приглашаются студенты, аспиранты и молодые ученые биологических, физических, химических и других естественно-научных специальностей. 

В программе школы предусмотрены лекции и мастер-классы по следующим направлениям:

подготовка растворов биополимеров перед кристаллизацией и кристаллизация макромолекулярных соединений; 

рентгеноструктурный анализ макромолекулярных соединений (МХ РСА);

докинг и молекулярная динамика;

исследование растворов биополимеров методом малоуглового рентгеновского рассеяния (БиоМУРР);

фундаментальные основы взаимодействия синхротронного излучения с веществом.

В этом году запланировано использование новых компьютерных классов НГУ, однако, для выполнения ряда заданий мастер-классов, необходим свой ноутбук. Содержание мастер-классов включают в себя  использование AlphaFold2 для предсказания пространственной структуры белков, проведение молекулярного докинга, построение фармакофорной модели, кристаллизацию белков, сбор первичных дифракционных данных, обработку массивов экспериментальных данных (РСА, МУРР) собранных на синхротронах DESY, КИСИ-Курчатов, SSRF.

Каждому участнику для прохождения мастер-классов необходимо будет выбрать группу.

Ниже перечислены мастер-классы (в порядке прохождения) для каждой группы

группа 1:
кристаллизация белков методом висячей капли;
электрофорез в нативных условиях; 
извлечение и заморозка кристаллов белков из маточного раствора; 
сбор первичных дифракционных данных для МХ РСА.
решение и уточнение кристаллической структуры лизоцима методом МХ РСА.

группа 2:
электрофорез в нативных условиях; 
поиск условий кристаллизации макромолекулярных соединений;
решение и уточнение кристаллической структуры лизоцима методом МХ РСА;
извлечение и заморозка кристаллов белков из маточного раствора; 
сбор первичных дифракционных данных для МХ РСА.

группа 3:
определение взаимодействия лиганда с белком методом поверхностного плазмонного резонанса;
использование нейросети AlphaFold2, проведение молекулярного докинга, построение фармакофорной модели;
возможности метода БиоМУРР - от первичных данных к пространственной модели.

группа 4:
использование нейросети AlphaFold2, проведение молекулярного докинга, построение фармакофорной модели;
построение теоретических кривых МУРР для биополимеров на основе моделей полученных методом молекулярной динамики;
возможности метода БиоМУРР - от первичных данных к пространственной медели.

Оргвзнос за участие в мероприятии не взимается. Количество мест ограничено (70 участников).

Для регистрации на Школу вы должны авторизоваться в системе https://conf.nsu.ru/, либо зарегистрироваться в ней, если у вас нет аккаунта. После авторизации в conf.nsu.ru из предложенных мероприятий нужно выбрать Школу и зарегистрироваться на нее. 

Регистрация на Школу может быть закрыта раньше установленного срока при заполнении свободных мест. Школа проводится в рамках Соглашения о предоставлении из федерального бюджета грантов в форме субсидий в соответствии с пунктом 4 статьи 78.1 Бюджетного кодекса Российской Федерации от «12» октября 2021 г. № 075-15-2021-1355 в рамках проекта развития синхротронных и нейтронных исследований и исследовательской инфраструктуры на 2019-2027 годы.

p.s. обеды и плюшки с кофе включены в программу